《最终幻想：灵魂深处》讲述了公元2065年，地球上充满了毁灭和混乱，城市荒芜，人口被大批残杀，整个世界造到外星生命的重创，他们通过独特的方式侵袭地球上的一切生命，少数生存下来的地球人开始反抗这些外星敌人。被毁灭的梦魇时刻缠绕着的天才女科学家罗丝是这场战争中拯救世界的关键人物，但她的计划要冒极大的危险，另一边掌握着高科技军队大权的将军也有一套自己的计划去打击外星敌人，但这个计划同样要对大自然造成更大的伤害，除非罗丝能成功……A scientist makes a last stand on Earth with the help of a ragtag team of soldiers against an invasion of alien phantoms.
