电影《亚人2：冲突》讲述了某天，普通高中生永井圭（宫野真守 配音）在放学路上被卡车撞倒，短暂的死亡过后，他悠然回到人间。作为日本第三位亚人，永井被警察、亚人管理委员会乃至赏金猎人等多方势力盯上。与此同时，被亚人管理委员会称为“帽子”的佐藤（大冢芳忠 配音）将受控的亚人田中功次（平川大辅 配音）。他向全国范围内发出信息，最终集结了7名亚人。佐藤试图策划大规模的虐杀恐怖行动，向日本政府发起冲击。在7名亚人中，中野攻心中的疑惑与日俱增。亚人VS亚人、亚人VS普通人，可怕的相互残杀即将发生……
