多亏了《复仇者联盟》中所有英雄的努力，在灭霸无限手套事件中化为灰烬的人们已经回到了世界。曾经失踪的蜘蛛侠彼得·帕克(Peter Parker)也已经恢复了正常生活。几个月后，蜘蛛侠彼得·帕克的学校举办了一次欧洲巡演。帕克也在其中。在欧洲威尼斯旅行时，一个巨大的怪物袭击了威尼斯。被敌人打败的蜘蛛侠，只有在被一个自称是神秘客人的人救出后才击退了敌人。此后，神盾局局长找到了正在旅行的彼得·帕克(Peter Parker)，并请他加入神盾局，安排神秘客人协助帕克。这位神秘的客人声称来自其他宇宙，并告诉一群邪恶势力，名为元素人群(Elemental Crowd)，他们已经入侵了宇宙。为了保护来之不易的和平，蜘蛛侠决定与这位神秘的客人携手共进。然而，在神秘客人的引擎盖里，似乎隐藏着一些未知的真相...
