午夜12点“深夜食堂”开始营业，老板（小林薰 饰）沉默可亲、厨艺精湛。这间充满人情味的小店成为大家觅食聚会、憩息畅谈的避风港。心情低落时就会穿“丧服”减压的赤冢范子（河井青叶 饰）接连遭遇了工作和感情双重打击；高木清太（池松壮亮 饰）爱上比自己大十几岁的女人而与母亲发生冲突；老太太小川夕起子（渡边美佐子 饰）始终无法走出抛夫弃子的阴影，在第一部中受食堂老板恩惠的小满（多部未华子 饰）收留老太太却不被理解，警察小暮（小田切让 饰）一如既往地维护着街区的平静……他们将如何解开心结，走出困境，“深夜食堂”在灯火阑珊中见证着一切。
